Entre 2005 y 2007 la Universidad generó un Plan Estratégico de Desarrollo, aprobado por el Consejo Directivo Central (CDC), que significó una hoja de ruta para el fortalecimiento de la institución en el territorio nacional.
En 2010, el Dr. Rodney Colina, director del Polo de Desarrollo Universitario de Virología de la Udelar, propuso la Creación del Primer Laboratorio en el Uruguay, Nivel de Bioseguridad 3 o P3, a construirse en el Centro Universitario (Cenur) Litoral Norte, en la sede Salto. El proyecto fue aprobado por el CDC el 6 de junio de 2010.
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